Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nup62Q63850 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nup62Q63850 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup62Q63850 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms