Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufa4Q62425 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufa4Q62425 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa4Q62425 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms