Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sf3a2Q62203 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sf3a2Q62203 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms