Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RhocQ62159 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RhocQ62159 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RhocQ62159 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RhocQ62159 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RhocQ62159 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RhocQ62159 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RhocQ62159 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RhocQ62159 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RhocQ62159 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RhocQ62159 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RhocQ62159 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RhocQ62159 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RhocQ62159 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RhocQ62159 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RhocQ62159 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RhocQ62159 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhocQ62159 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RhocQ62159 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhocQ62159 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhocQ62159 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhocQ62159 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms