Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtafrQ62035 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtafrQ62035 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtafrQ62035 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms