Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psmb6Q60692 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Psmb6Q60692 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Psmb6Q60692 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms