Protein–RNA interactions for Protein: Q5UAK0

Mier1, Mesoderm induction early response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier1Q5UAK0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Mier1Q5UAK0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Mier1Q5UAK0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Mier1Q5UAK0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms