Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
9930111J21Rik1Q5SVP0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
9930111J21Rik1Q5SVP0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms