Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Znrf3Q5SSZ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Znrf3Q5SSZ7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znrf3Q5SSZ7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms