Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rtp3Q5QGU6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rtp3Q5QGU6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rtp3Q5QGU6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms