Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCQ5

Dph1, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph1Q5NCQ5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dph1Q5NCQ5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dph1Q5NCQ5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dph1Q5NCQ5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms