Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Rapgef6Q5NCJ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Rapgef6Q5NCJ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rapgef6Q5NCJ1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rapgef6Q5NCJ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rapgef6Q5NCJ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Rapgef6Q5NCJ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rapgef6Q5NCJ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rapgef6Q5NCJ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rapgef6Q5NCJ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rapgef6Q5NCJ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rapgef6Q5NCJ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rapgef6Q5NCJ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rapgef6Q5NCJ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rapgef6Q5NCJ1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rapgef6Q5NCJ1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.1 ms