Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trpm3Q5F4S9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trpm3Q5F4S9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Trpm3Q5F4S9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Trpm3Q5F4S9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms