Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Foxn3Q499D0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Foxn3Q499D0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxn3Q499D0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxn3Q499D0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms