Protein–RNA interactions for Protein: Q497M0

Samt2, Predicted gene, EG434881, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt2Q497M0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Samt2Q497M0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samt2Q497M0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms