Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pacs2Q3V3Q7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pacs2Q3V3Q7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pacs2Q3V3Q7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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