Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BC051142Q3V0M8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BC051142Q3V0M8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BC051142Q3V0M8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms