Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3V0E1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3V0E1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3V0E1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3V0E1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3V0E1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3V0E1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3V0E1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3V0E1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3V0E1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3V0E1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3V0E1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3V0E1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3V0E1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3V0E1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3V0E1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3V0E1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3V0E1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q3V0E1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q3V0E1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3V0E1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms