Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc27Q3V036 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc27Q3V036 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc27Q3V036 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms