Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clca4bQ3UW98 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Clca4bQ3UW98 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms