Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV71

Tmtc1, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc1Q3UV71 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmtc1Q3UV71 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmtc1Q3UV71 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmtc1Q3UV71 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc1Q3UV71 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc1Q3UV71 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc1Q3UV71 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc1Q3UV71 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc1Q3UV71 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc1Q3UV71 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc1Q3UV71 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc1Q3UV71 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc1Q3UV71 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmtc1Q3UV71 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms