Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nkx6-3Q3UHX8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nkx6-3Q3UHX8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms