Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdhd2Q3UGR5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdhd2Q3UGR5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdhd2Q3UGR5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms