Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrp36Q3UFY0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rrp36Q3UFY0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rrp36Q3UFY0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms