Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ctu2Q3U308 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ctu2Q3U308 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ctu2Q3U308 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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