Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem104Q3TB48 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem104Q3TB48 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem104Q3TB48 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms