Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Samd11Q1RNF8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd11Q1RNF8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Samd11Q1RNF8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd11Q1RNF8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd11Q1RNF8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Samd11Q1RNF8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms