Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd300lgQ1ERP8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd300lgQ1ERP8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300lgQ1ERP8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms