Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc138Q0VF22 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc138Q0VF22 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms