Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cntnap5aQ0V8T9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cntnap5aQ0V8T9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cntnap5aQ0V8T9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms