Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NeblQ0II04 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NeblQ0II04 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NeblQ0II04 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms