Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ssrp1Q08943 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ssrp1Q08943 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ssrp1Q08943 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms