Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MitfQ08874 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MitfQ08874 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MitfQ08874 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MitfQ08874 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MitfQ08874 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MitfQ08874 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MitfQ08874 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MitfQ08874 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MitfQ08874 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MitfQ08874 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MitfQ08874 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms