Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfdp1Q08639 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfdp1Q08639 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tfdp1Q08639 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfdp1Q08639 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfdp1Q08639 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfdp1Q08639 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfdp1Q08639 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tfdp1Q08639 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms