Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Siah2Q06986 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Siah2Q06986 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms