Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prrx2Q06348 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prrx2Q06348 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prrx2Q06348 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms