Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SryQ05738 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SryQ05738 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SryQ05738 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SryQ05738 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SryQ05738 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SryQ05738 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SryQ05738 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SryQ05738 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SryQ05738 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SryQ05738 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SryQ05738 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SryQ05738 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SryQ05738 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SryQ05738 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SryQ05738 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SryQ05738 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SryQ05738 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SryQ05738 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SryQ05738 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SryQ05738 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SryQ05738 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SryQ05738 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SryQ05738 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SryQ05738 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SryQ05738 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SryQ05738 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SryQ05738 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SryQ05738 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SryQ05738 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SryQ05738 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SryQ05738 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SryQ05738 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SryQ05738 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SryQ05738 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SryQ05738 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SryQ05738 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SryQ05738 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SryQ05738 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SryQ05738 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SryQ05738 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SryQ05738 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SryQ05738 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SryQ05738 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SryQ05738 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SryQ05738 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SryQ05738 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SryQ05738 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SryQ05738 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SryQ05738 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SryQ05738 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SryQ05738 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SryQ05738 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SryQ05738 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SryQ05738 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SryQ05738 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SryQ05738 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SryQ05738 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SryQ05738 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SryQ05738 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SryQ05738 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SryQ05738 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SryQ05738 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SryQ05738 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SryQ05738 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SryQ05738 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SryQ05738 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SryQ05738 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SryQ05738 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SryQ05738 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SryQ05738 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms