Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Epha4Q03137 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Epha4Q03137 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Epha4Q03137 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms