Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PrkczQ02956 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PrkczQ02956 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkczQ02956 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms