Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Htr1fQ02284 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Htr1fQ02284 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms