Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoa1Q00623 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoa1Q00623 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoa1Q00623 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms