Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tarbp2P97473 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tarbp2P97473 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tarbp2P97473 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms