Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bop1P97452 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bop1P97452 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bop1P97452 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bop1P97452 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bop1P97452 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bop1P97452 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bop1P97452 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bop1P97452 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bop1P97452 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bop1P97452 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bop1P97452 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bop1P97452 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms