Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pkp1P97350 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pkp1P97350 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pkp1P97350 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkp1P97350 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms