Protein–RNA interactions for Protein: P97291

Cdh8, Cadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh8P97291 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh8P97291 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh8P97291 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh8P97291 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms