Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cux2P70298 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Cux2P70298 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cux2P70298 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Cux2P70298 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cux2P70298 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Cux2P70298 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Cux2P70298 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cux2P70298 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cux2P70298 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Cux2P70298 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Cux2P70298 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cux2P70298 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Cux2P70298 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Cux2P70298 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms