Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxna1P70206 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxna1P70206 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxna1P70206 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxna1P70206 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxna1P70206 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxna1P70206 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxna1P70206 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxna1P70206 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Plxna1P70206 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxna1P70206 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms