Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta2P62737 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta2P62737 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Acta2P62737 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acta2P62737 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta2P62737 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta2P62737 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta2P62737 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta2P62737 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acta2P62737 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta2P62737 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acta2P62737 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms