Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CgnP59242 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CgnP59242 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CgnP59242 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CgnP59242 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CgnP59242 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CgnP59242 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CgnP59242 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CgnP59242 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CgnP59242 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CgnP59242 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CgnP59242 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CgnP59242 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CgnP59242 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CgnP59242 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CgnP59242 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CgnP59242 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CgnP59242 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CgnP59242 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CgnP59242 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CgnP59242 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CgnP59242 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CgnP59242 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CgnP59242 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CgnP59242 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CgnP59242 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CgnP59242 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CgnP59242 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CgnP59242 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CgnP59242 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CgnP59242 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CgnP59242 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CgnP59242 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CgnP59242 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CgnP59242 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CgnP59242 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CgnP59242 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CgnP59242 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CgnP59242 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CgnP59242 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CgnP59242 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CgnP59242 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CgnP59242 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CgnP59242 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CgnP59242 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CgnP59242 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CgnP59242 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CgnP59242 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CgnP59242 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CgnP59242 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CgnP59242 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CgnP59242 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CgnP59242 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CgnP59242 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CgnP59242 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CgnP59242 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CgnP59242 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CgnP59242 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CgnP59242 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CgnP59242 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CgnP59242 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CgnP59242 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CgnP59242 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CgnP59242 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CgnP59242 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CgnP59242 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CgnP59242 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CgnP59242 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CgnP59242 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CgnP59242 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CgnP59242 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CgnP59242 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CgnP59242 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CgnP59242 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CgnP59242 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CgnP59242 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CgnP59242 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CgnP59242 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CgnP59242 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CgnP59242 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CgnP59242 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CgnP59242 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CgnP59242 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CgnP59242 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CgnP59242 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CgnP59242 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CgnP59242 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CgnP59242 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CgnP59242 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CgnP59242 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CgnP59242 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CgnP59242 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CgnP59242 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CgnP59242 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CgnP59242 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CgnP59242 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CgnP59242 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CgnP59242 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CgnP59242 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CgnP59242 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms