Protein–RNA interactions for Protein: P57722

Pcbp3, Poly(rC)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp3P57722 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pcbp3P57722 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pcbp3P57722 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pcbp3P57722 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms